EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE002-00002 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo_early 
Coordinate
chrI:21547-23701 
TF binding sites/motifs
Number: 94             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:23461-23471TCTCCCTCAT-3.07
blmp-1MA0537.1chrI:23468-23478CATCGATTTC-3.18
blmp-1MA0537.1chrI:23316-23326CTTCACCTCT-3.23
blmp-1MA0537.1chrI:22954-22964CCTCGATCTC-3.24
blmp-1MA0537.1chrI:23474-23484TTTCTTCTTC-3.31
blmp-1MA0537.1chrI:22187-22197AAATTGAATA+3.46
blmp-1MA0537.1chrI:23252-23262TCTCAACTTC-3.68
blmp-1MA0537.1chrI:23238-23248CTTCTCCTTC-3.6
blmp-1MA0537.1chrI:23480-23490CTTCAATTTT-3.97
blmp-1MA0537.1chrI:22236-22246AAGTAGAATA+3
blmp-1MA0537.1chrI:22818-22828AAATGGAGAG+4.28
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrI:23607-23620TGCTGAAACCAAT-3.59
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrI:22788-22801TAATGATAACAAT-4.28
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrI:22800-22813TAACGAACATAAT-4.45
ceh-22MA0264.1chrI:23346-23356CTCCTTGACA+3.21
ceh-22MA0264.1chrI:22631-22641CCACTTTAGG+3.3
ceh-22MA0264.1chrI:22178-22188CCACTTTTAA+3
ceh-48MA0921.1chrI:23194-23202TATCGAAA-3.29
ceh-48MA0921.1chrI:23468-23476CATCGATT-3.41
ceh-48MA0921.1chrI:21552-21560ATCAATAA+3.44
ceh-48MA0921.1chrI:22013-22021TATTGATA-3.44
ces-2MA0922.1chrI:22403-22411TGCGTACT-3.07
ces-2MA0922.1chrI:22677-22685TAATATAA+4.08
che-1MA0260.1chrI:23152-23157GCTTC-3.2
che-1MA0260.1chrI:22888-22893AAACC+3.36
che-1MA0260.1chrI:23612-23617AAACC+3.36
che-1MA0260.1chrI:22921-22926AAGCC+3.7
che-1MA0260.1chrI:23014-23019AAGCC+3.7
che-1MA0260.1chrI:23053-23058AAGCC+3.7
che-1MA0260.1chrI:23080-23085AAGCC+3.7
che-1MA0260.1chrI:23121-23126GCTTC-3.7
daf-12MA0538.1chrI:21871-21885AGTGTGACTGGAGC+3.88
daf-12MA0538.1chrI:23553-23567CCGCAGTCACGTCC-3.93
dsc-1MA0919.1chrI:23175-23184CAAATTAGA+3.03
dsc-1MA0919.1chrI:23175-23184CAAATTAGA-3.03
dsc-1MA0919.1chrI:22425-22434TTAATTGAC+3.14
dsc-1MA0919.1chrI:22425-22434TTAATTGAC-3.14
efl-1MA0541.1chrI:21778-21792ATCCGCGCGCACAG+3.29
efl-1MA0541.1chrI:21755-21769CATTTGCGCTCTGA-3.2
efl-1MA0541.1chrI:21819-21833AATGCGCGCGGAGC-3.39
efl-1MA0541.1chrI:21777-21791TATCCGCGCGCACA-3.64
elt-3MA0542.1chrI:22253-22260GAGAAAA-3.02
elt-3MA0542.1chrI:21691-21698GCTAAAA-3.07
elt-3MA0542.1chrI:22643-22650GATAAAA-3.07
elt-3MA0542.1chrI:22103-22110TTTAACA+3.14
elt-3MA0542.1chrI:23628-23635GATGAGA-3.35
elt-3MA0542.1chrI:22520-22527GAAAAAA-3
elt-3MA0542.1chrI:22792-22799GATAACA-4.15
elt-3MA0542.1chrI:22662-22669GATAAAA-4.31
eor-1MA0543.1chrI:23245-23259TTCTGATTCTCAAC-3.53
eor-1MA0543.1chrI:23410-23424ATCTGCTTCTTCTT-3.56
eor-1MA0543.1chrI:23231-23245GTCTATTCTTCTCC-3.62
fkh-2MA0920.1chrI:22645-22652TAAAAAT+3.04
fkh-2MA0920.1chrI:22815-22822TAAAAAT+3.04
fkh-2MA0920.1chrI:23171-23178AAAACAA+3.09
fkh-2MA0920.1chrI:22658-22665TGTTGAT-3.66
fkh-2MA0920.1chrI:22762-22769TAAACAG+3.89
fkh-2MA0920.1chrI:23423-23430TGTTTAT-4.31
hlh-1MA0545.1chrI:22705-22715GCAAGTGTTA-3.19
hlh-1MA0545.1chrI:22704-22714AGCAAGTGTT+3.36
hlh-1MA0545.1chrI:22855-22865AGCAACTGAT+4.06
lim-4MA0923.1chrI:22426-22434TAATTGAC-3.65
lim-4MA0923.1chrI:21837-21845GCAATTAG+3.73
lin-14MA0261.1chrI:22452-22457AACAT+3.14
lin-14MA0261.1chrI:22805-22810AACAT+3.14
mab-3MA0262.1chrI:21603-21615ATGTTGCTAAAG+4.33
pal-1MA0924.1chrI:22797-22804CAATAAC+3.24
pal-1MA0924.1chrI:22812-22819TAATAAA+3.63
pha-4MA0546.1chrI:22382-22391GTGTAAACT+3.13
pha-4MA0546.1chrI:22014-22023ATTGATACG-3.35
pha-4MA0546.1chrI:21550-21559GTATCAATA+3.51
pha-4MA0546.1chrI:22688-22697GTGCAAATA+4.45
pha-4MA0546.1chrI:22759-22768GAGTAAACA+4.96
skn-1MA0547.1chrI:22788-22802TAATGATAACAATA+3.14
skn-1MA0547.1chrI:23250-23264ATTCTCAACTTCTT-3.75
skn-1MA0547.1chrI:22283-22297AATAGCTGAAATAT+3.86
skn-1MA0547.1chrI:22318-22332CATGGATGAGAATT+3.86
skn-1MA0547.1chrI:22775-22789ATATTCATGATTAT-3.8
skn-1MA0547.1chrI:23475-23489TTCTTCTTCAATTT-3.8
skn-1MA0547.1chrI:22655-22669AATTGTTGATAAAA+4.34
sma-4MA0925.1chrI:23229-23239CTGTCTATTC+3.15
sma-4MA0925.1chrI:21708-21718CCCAGACCCT-3.83
sma-4MA0925.1chrI:21874-21884GTGACTGGAG+3.84
snpc-4MA0544.1chrI:21747-21758GCAGCCCACAT-3.32
unc-62MA0918.1chrI:23370-23381AATGACACGTT-3.4
unc-62MA0918.1chrI:23572-23583AAATGTCTTGT+3
unc-86MA0926.1chrI:22673-22680TGAATAA-3.58
unc-86MA0926.1chrI:22776-22783TATTCAT+3.87
vab-7MA0927.1chrI:23190-23197CAATTAT-3.15
vab-7MA0927.1chrI:22496-22503TAATGAG-3.19
vab-7MA0927.1chrI:21838-21845CAATTAG-3.38
zfh-2MA0928.1chrI:22424-22434TTTAATTGAC+3.07
zfh-2MA0928.1chrI:23175-23185CAAATTAGAA-3.15
zfh-2MA0928.1chrI:22868-22878AGAATTAACG-3.19
Enhancer Sequence
CCAGTATCAA TAATATCCCG TGCCAATTTT CATAAAACTG AATATAAATT GGGTTGATGT 60
TGCTAAAGGG CTGCGAAAAA CTGACCTGGG ATGAAGCTGG GCTGCAAGGG GCTGCGAAGT 120
GCTGCGAGGG CAAAGCGCTA CAGTGCTAAA AGGGGGCTGA GCCCAGACCC TCAGGAAAAA 180
ACTCATACTC GCAGCCCTTC GCAGCCCACA TTTGCGCTCT GATCGCGTGC TATCCGCGCG 240
CACAGAATTT CGAAAGTATT TTCCAAATTC GGAATGCGCG CGGAGCAGAC GCAATTAGAG 300
CGCGGATCTG GCACGTAAGG AAGAAGTGTG ACTGGAGCAC GAACCAGTAA TCTAGTCGCG 360
CCCCGTCCGC GCTCCAGGAG GAGCGATTTG CCGAGCAGTT CAGCCCTTCG CAGCCCTTTA 420
GCAACAACCA AATTTATACA GTTTTATGAA AATTGGAACG GGATATTATT GATACGCCTA 480
AGCAGCCCTA TTAAATAGTG ATGAGGGCGT AAATGAAATT CGCCATTTCC AGCTAAAATA 540
TAAATTTTTT GAATTTTTTA ACATTGATAT TCGGAATGGA TTCAGCAGAA AATTTGAAGT 600
CATTTGAAAA TATTTTCCAG ATTTCGGTAC TCCACTTTTA AAATTGAATA AAACTGTAGT 660
CTTTATTCAA TGTTTCTTCA AAATTTAAAA AGTAGAATAT AACTGTGAGA AAATTTCCAA 720
AATTGTCAAA ATTTCAAATA GCTGAAATAT TTCACGGCCC GGCGGGGGGT ACATGGATGA 780
GAATTCTCTA CCGTATTCCA ATTTGGCTGA CTGCGTGCTC AACGTTGAAT ACTCAGTGTA 840
AACTTTCGTA CACCGTTGCG TACTGCACAG CGCGCATTTT AATTGACGAC ATTTAGCAAA 900
AATTGAACAT AAGATTTTTC GGAATTATGA AGCTCAATTT TCACAAAAAT AATGAGTTTT 960
TTGTAGAATT TATGAAAAAA CGTGAATATA TAGATTTTTT GTTCATGATA TTCAAGAAAA 1020
AGCGATTTTT AGTTCTTCAC AGAGGAATCC TCTCGCATTT CACTTGCTCA TGATGTTTTT 1080
TGCTCCACTT TAGGACGATA AAAATGCGAA TTGTTGATAA AATGAATGAA TAATATAAAA 1140
AGTGCAAATA TGACTTCAGC AAGTGTTAAA TCCCAAATTT TTCCTGCGAT TTTCTGCTAG 1200
ATTCCTGGTT TTGAGTAAAC AGTCTGATAT ATTCATGATT ATAATGATAA CAATAACGAA 1260
CATAATAATA AAAATGGAGA GCACAGAGAA ACAACAAATT GCAAAAACAG CAACTGATAT 1320
CAGAATTAAC GACGACCACG GAAACCGCCT CGGTCTCCAC CTCGCCCACC ACGGAAGCCA 1380
CCACCTCTGT CGCGTCCTCT GAATCCTCCT CGATCTCCAC CGAATCCACC TCTAAATCCT 1440
CCATCGCGGT CTTCTGATCT ACCACGGAAG CCTCCACCTC CACCAGGATC TGTTGAAAGT 1500
CCTCTGAAGC CTCCTCGATC GCCACCTCCA CGGAAGCCAC CACGATCCGC GGATTTTCCT 1560
CTATAGCCTT CGAGGCTTCA GTTGTACCCC ATTCTTCGTT GGCACGCTTC AGATCTCTAC 1620
AAAAAAAACA AATTAGAAGC ATTCAATTAT CGAAATGTGT ACCTATCCCG ATTTATCGCA 1680
ATCTGTCTAT TCTTCTCCTT CTGATTCTCA ACTTCTTTAA CTTGTCCAGT AGCGGCAGCT 1740
TGCTTACGAG CAGCATTTTC CCGAATCGCC TTCACCTCTG CCTCCTCAGC ATCCTGTTGC 1800
TCCTTGACAA TCGTAAGTCT TCGAATGACA CGTTGCTCAC TCTCCTGCTC ACGACGCTTT 1860
TTCATCTGCT TCTTCTTGTT TATAGTCACC GCATTATGCT TGTGATAGAG AACCTCTCCC 1920
TCATCGATTT CTTCTTCAAT TTTGACGAGT TCCAGGGTCA GTCGGGTCCG ATCTCACGAA 1980
GACGGACGTT GCTATTCTGG CCAATTCCGC AGTCACGTCC TTCATAAATG TCTTGTGGAA 2040
GTTCTTCTTG CTGAGGGGGC TGCTGAAACC AATGTCGGCA TGATGAGAGT TCCGGTCTTC 2100
TGAATCCATT TCCTGCGTGG GCTGTGGCGA CGAGCTGCAC GTCTGAAAAT CAAG 2154