EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
CE001-00207 
Organism
Caenorhabditis elegans 
Tissue/cell
Embryo 
Coordinate
chrI:13498518-13499301 
TF binding sites/motifs
Number: 64             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
blmp-1MA0537.1chrI:13499005-13499015CCTCCCCCTC-3.13
blmp-1MA0537.1chrI:13499173-13499183AGGAAGAGAG+3.41
blmp-1MA0537.1chrI:13499175-13499185GAAGAGAGAC+3.6
blmp-1MA0537.1chrI:13498919-13498929AAAATGAAGA+4.15
ceh-10|ttx-3MA0263.1chrI:13498789-13498802TTTTGTTAGTTAG+3.32
ceh-22MA0264.1chrI:13498992-13499002GACAAGTGCC-3.79
ceh-22MA0264.1chrI:13499127-13499137GCACTTGATA+4.01
ces-2MA0922.1chrI:13498833-13498841TTACACAA+3.15
ces-2MA0922.1chrI:13499063-13499071TTATGCAA+4.22
che-1MA0260.1chrI:13498978-13498983GTTTC-3.06
daf-12MA0538.1chrI:13499080-13499094ACGCAGACACCCAA-3.93
dsc-1MA0919.1chrI:13499068-13499077CAAATTAGA+3.07
dsc-1MA0919.1chrI:13499068-13499077CAAATTAGA-3.07
dsc-1MA0919.1chrI:13499225-13499234TCAATTAAT+3.27
dsc-1MA0919.1chrI:13499225-13499234TCAATTAAT-3.27
dsc-1MA0919.1chrI:13498765-13498774ATAATTACC+3.4
dsc-1MA0919.1chrI:13498765-13498774ATAATTACC-3.4
efl-1MA0541.1chrI:13498821-13498835CTCCCCGCCAAGTT+3.2
efl-1MA0541.1chrI:13498820-13498834ACTCCCCGCCAAGT-3.41
elt-3MA0542.1chrI:13499133-13499140GATATGA-3.58
eor-1MA0543.1chrI:13499073-13499087TAGAGAGACGCAGA+3.4
eor-1MA0543.1chrI:13498917-13498931GAAAAATGAAGAAA+3.65
eor-1MA0543.1chrI:13499170-13499184ACGAGGAAGAGAGA+4.21
eor-1MA0543.1chrI:13499004-13499018CCCTCCCCCTCTTC-4.25
eor-1MA0543.1chrI:13499075-13499089GAGAGACGCAGACA+7.93
fkh-2MA0920.1chrI:13498523-13498530TGTTTTC-3.01
fkh-2MA0920.1chrI:13498601-13498608TATACAA+3.35
hlh-1MA0545.1chrI:13498993-13499003ACAAGTGCCC-3.35
lim-4MA0923.1chrI:13498801-13498809GCAATTAC+3.01
lim-4MA0923.1chrI:13499225-13499233TCAATTAA+3.52
lim-4MA0923.1chrI:13498766-13498774TAATTACC-3.55
lin-14MA0261.1chrI:13498649-13498654TGTTC-3.01
mab-3MA0262.1chrI:13498770-13498782TACCGCAAAATT-3.58
pal-1MA0924.1chrI:13498766-13498773TAATTAC+3.33
pal-1MA0924.1chrI:13498802-13498809CAATTAC+3.59
pal-1MA0924.1chrI:13498613-13498620TTACTAC-3
pha-4MA0546.1chrI:13498650-13498659GTTCACTCT-3.25
pha-4MA0546.1chrI:13499262-13499271GTTGGTATT-3.57
skn-1MA0547.1chrI:13498920-13498934AAATGAAGAAAATA+5.23
sma-4MA0925.1chrI:13498913-13498923CCTAGAAAAA-3.01
sma-4MA0925.1chrI:13498808-13498818CTTTCTAGCT+3.17
sma-4MA0925.1chrI:13499081-13499091CGCAGACACC-3.4
snpc-4MA0544.1chrI:13499079-13499090GACGCAGACAC-3.93
unc-62MA0918.1chrI:13499159-13499170ATATGTCAAGC+3.15
unc-62MA0918.1chrI:13499179-13499190AGAGACAAGTT-3.21
unc-62MA0918.1chrI:13498688-13498699TCATGTCATCT+3.34
unc-62MA0918.1chrI:13498960-13498971GGCTGTCAACT+3.55
unc-62MA0918.1chrI:13498989-13499000ATTGACAAGTG-3.8
unc-86MA0926.1chrI:13499066-13499073TGCAAAT-3.09
unc-86MA0926.1chrI:13498564-13498571AATGCAT+3.11
unc-86MA0926.1chrI:13498566-13498573TGCATTT-3.11
unc-86MA0926.1chrI:13499267-13499274TATTAAT+3.35
unc-86MA0926.1chrI:13499229-13499236TTAATAT-3.47
unc-86MA0926.1chrI:13499250-13499257TATGAAT+3.58
vab-7MA0927.1chrI:13498795-13498802TAGTTAG-3.05
vab-7MA0927.1chrI:13498766-13498773TAATTAC-3.19
vab-7MA0927.1chrI:13498766-13498773TAATTAC+3.6
zfh-2MA0928.1chrI:13499274-13499284TTTAATTTAA+3.07
zfh-2MA0928.1chrI:13499268-13499278ATTAATTTTA+3.08
zfh-2MA0928.1chrI:13499252-13499262TGAATTAGGT-3.11
zfh-2MA0928.1chrI:13499068-13499078CAAATTAGAG-3.16
zfh-2MA0928.1chrI:13499225-13499235TCAATTAATA-3.28
zfh-2MA0928.1chrI:13498765-13498775ATAATTACCG-3.37
zfh-2MA0928.1chrI:13498764-13498774AATAATTACC+3.4
Enhancer Sequence
CTTCATGTTT TCTACATTGT CTTTACGCCC CTATATCTCA ATGAAAAATG CATTTAAAAA 60
GAAATTCACA ACTAGTCAGA TAATATACAA AAAATTTACT ACACTTTGTT AGTTAACAAC 120
TTTTCCATAA CTGTTCACTC TCTAGAGTTA TGGGGCTTTG AAGACTACAT TCATGTCATC 180
TACATTGTCT TTAAACTCCC ATATCTCAAC GAACAATGGA TTTAACAAAA AGTTTCCAAC 240
TAGCAAAATA ATTACCGCAA AATTCCCTAC ATTTTGTTAG TTAGCAATTA CTTTCTAGCT 300
CAACTCCCCG CCAAGTTACA CAAGTTTTAA AATTTTAGGT ACGGAGCTAT CAAGCTATCA 360
AATAGGTCTA AATATTGTAG TTTATAGTGT CCTAACCTAG AAAAATGAAG AAAATAGTAA 420
GAATGTGAGA ATTTGTGAAA ATGGCTGTCA ACTTCACGTC GTTTCGTGTC AATTGACAAG 480
TGCCCCCCCT CCCCCTCTTC CAATTGCGAA ACAAGTCTTT CACTGAGAGA ATATAAGTAG 540
AGAGATTATG CAAATTAGAG AGACGCAGAC ACCCAAAGAC CATTGTCATT GTTTGGATAA 600
GCTCTCATGG CACTTGATAT GATATAGGGA GGTTAAGCAT GATATGTCAA GCACGAGGAA 660
GAGAGACAAG TTGATCTGGT TAGTATGTAG TTTGTAGTCA CTGAGCCTCA ATTAATATGC 720
TATTGACAAC CTTATGAATT AGGTGTTGGT ATTAATTTTA ATTTAAGAAA AGTTTCAAAA 780
TTT 783